Hệ vi sinh vật đường ruột của chúng ta đã trở thành trọng tâm nghiên cứu trong vài năm qua sau khi hàng nghìn tỷ vi sinh vật sống trong hệ tiêu hóa được phát hiện đóng một vai trò quan trọng trong việc duy trì sức khỏe con người.
Phần lớn các sinh vật này trong ruột của chúng ta là vi khuẩn, nhưng hệ vi sinh vật đường ruột không chỉ là một quần thể vi khuẩn khổng lồ - nó còn bao gồm ký sinh trùng, nấm và vi rút.
Lập danh mục các cư dân vi sinh vật khác này không dễ dàng. Không giống như vi khuẩn, vi rút thiếu bất kỳ dấu hiệu di truyền chung nào. Trên thực tế, từ 40 đến 90% trình tự gen của vi rút được gọi là “vật chất tối của vi rút”, có nghĩa là chúng không khớp với bất kỳ trình tự vi rút tham chiếu nào đã biết.
Vì vậy, bước đầu tiên của các nhà nghiên cứu là tổng hợp dữ liệu từ hàng chục nghiên cứu trước đó về virus trong ruột người. Bộ dữ liệu cuối cùng được biên soạn bao gồm gần 2.000 người trên 16 quốc gia.
Tác giả đầu tiên, Ann Gregory, giải thích: “Chúng tôi đã sử dụng công nghệ máy học trên các loại virus đã biết để giúp chúng tôi xác định các loại virus chưa biết. "Chúng tôi quan tâm đến việc có bao nhiêu loại vi rút mà chúng tôi có thể nhìn thấy trong ruột và chúng tôi xác định rằng chúng tôi có thể nhìn thấy bao nhiêu loại bộ gen vì chúng tôi không thể nhìn thấy bằng mắt các vi rút."
Nghiên cứu đã hoàn thành việc lập danh mục 33.242 quần thể virus độc nhất, thiết lập một nguồn tài liệu tham khảo mã nguồn mở mới được gọi là Cơ sở dữ liệu Gut Virome. |