Lignocellulose, thành phần cơ bản của sinh khối thực vật, là nguồn nguyên liệu hàng đầu để sản xuất nhiên liệu sinh học (Tartar et al., 2009). Tuy nhiên, hiện nay, quy trình công nghiệp được sử dụng để chuyên hóa lignocellulose gặp nhiều khó khăn do tính rắn chắc của nguyên liệu và chưa có nguồn enzyme thủy phân hiệu quả. Việc tìm ra các enzyme mới để cải thiện quy trình, làm giảm giá thành sản phẩm đang được các nhà khoa học trên thế giới đặc biệt quan tâm. Mối là động vật chân khớp, có ở khắp nơi và tiêu hóa lignocellulose hiệu quả. Ngoài các enzyme phân giải cellulose có từ bản thân mối, các vi sinh vật cộng sinh trong ruột mối cũng đóng vai trò đáng kể làm tăng hiệu quả chuyển hóa lignocellulose. Do đó, ruột môi được xem là nguồn tiềm năng để khai thác các gen mã hóa enzyme phân giải lignocellulose cho các nghiên cứu định hướng ứng dụng.

Những vi sinh vật này (phần lớn là vi sinh vật không nuôi cấy được) tiết ra các enzyme thủy phân hoàn toàn lignocellulose thành đường. Với mục đích chuyên hóa được phế phụ phẩm nông nghiệp đang bị bỏ phí (đặc biệt là rơm rạ) thành các chất giá trị hơn, các enzyme thủy phân lignocellulose từ hệ vi sinh vật trong ruột mối được xem là nguồn enzyme có tiềm năng lớn. Do đó, xây dựng một thư viện metagenome của vi sinh vật trong ruột mối có chất lượng cao là rất cần thiết đê từ đó sàng lọc gen mã hóa enzyme tham gia thủy phân ligocellulose thành đường. Trong nghiên cứu này, DNA metagenome của vi sinh vật trong ruột mối được tách chiết thành công bằng cách kết hợp phương pháp tách chiết truyền thống và phương pháp tách chiết dựa trên bộ sinh phẩm của Qiagen. Sau đó, sản phẩm tách được cắt thành những đoạn có kích thước từ 3-7 kb bằng HeaIII, nối vào vector pJET1.2/blunt và biến nạp xung điện vào chủng E. coli DH10B nhằm mục đích xây dựng thư viện metagenome. Sử dụng vector pUC19 làm DNA chuẩn, chúng tôi xác định được hiệu quả biến nạp phụ thuộc nhiều vào pha sinh trưởng log của tế bào được dùng làm tế bào khả biến, tốc độ ly tâm trong khi thu mẫu và điện áp trong quá trình xung điện. Thư viện metagenome đã được xây dựng thành công với hiệu quả biến nạp vào tế bào E. coli DH10B là 3,7 X 10⁹ CFU/µg DNA plasmid khi tế bào được thu ở đầu pha log với OD₆₀₀ đạt 0,2, tốc độ ly tâm thu mẫu 1500 vòng/phút và xung điện ở 1,5 kV đối với cuvet có kích thước khe 0,1 cm. 100% plasmid từ thư viện mang DNA ngoại lai, trong đó 47% mang DNA lớn kích thước 3-5 kb.

Kết quả nghiên cứu đã xây dựng thành công thư viện DNA metagenome của hệ vi sinh vật trong ruột mối, trong đó, 46,7% dòng mang DNA kích thước trên 3kb. Thư viện này sẽ được sử dụng để sang lọc gen mã hóa enzyme thủy phân lignocellulose.