Trên cơ sở số liệu nền được thu thập tại phòng Thống kê, phòng Nông nghiệp và PTNT, Trung tâm Khuyến ngư huyện Thạnh Phú, nhiều số liệu về hiện trạng môi trường cũng như nuôi trồng thủy sản đã được tổng hợp, nghiên cứu và đánh giá. Số liệu còn được thu thập trực tiếp tại Ủy ban nhân dân các xã Mỹ An, An Thạnh, An Thuận, An Quí, Bình Thạnh, An Điền, An Nhơn, Thạnh Phong, Thạnh Hải, Giao Thạnh. Ngoài ra, đề tài đã thu thập có chọn lọc những tài liệu có liên quan cho việc phân tích đánh giá sau này. Điều tra khảo sát trực tiếp tại các hộ nuôi trồng thủy sản bằng cách phát phiếu điều tra theo mẫu soạn sẵn tại 3 vùng sinh thái, mỗi vùng chọn ngẫu nhiên 30 hộ dân. Điều tra nhằm xác định, tìm hiểu tập quán và kỹ thuật nuôi trồng thủy sản của các hộ nuôi, từ đó xác định các vấn đề còn tồn tại trong hoạt động nuôi trồng tại địa phương có thể tác động trực tiếp đến năng suất và chất lượng môi trường vùng nuôi cũng như các yếu tố có thể gây suy thoái môi trường đất, nước (mặn hóa, phèn hóa).

Qua thời gian nghiên cứu cho thấy, bên cạnh các yếu tố tự nhiên như cường độ mưa (Nguyễn Đình Vượng và Đinh Quang Toàn, 2010), khí hậu thời tiết, nguồn xâm nhập mặn, còn tồn tại nhiều yếu tố bất lợi tác động tiêu cực đến việc phát triển NTTS bền vững như trình độ văn hóa ngư dân kém, kỹ thuật nuôi trồng chưa đảm bảo cũng như việc nuôi tôm của các nông hộ còn mang tính tự phát, phá vỡ quy hoạch đối với việc phát triển nuôi thủy sản bền vững tại địa phương dẫn đến suy thoái môi trường đất và nước. Tuy nhiên, yếu tố hiện trạng sản xuất của nông dân vẫn có tác động tích cực đến tính bền vững của các loại hình nuôi trồng thủy sản trên địa bàn huyện như số lao động trong hộ gia đình đáp ứng đủ nhu cầu về nguồn nhân lực quá trình nuôi trồng. Do đó cần có những nghiên cứu chuyên sâu về động thái và diễn biến chất lượng môi trường trên địa bàn huyện Thạnh Phú thực hiện đồng thời với công tác hỗ trợ, tập huấn cho các nông hộ nhằm xây dựng mô hình nuôi trồng thủy sản theo hướng phát triển bền vững.