Nông - Lâm - Ngư nghiệp
[ Đăng ngày (26/04/2021) ]
|
Nghiên cứu xác định đoạn DNA barcode cho loài bách vàng (callitropsis vietnamensis): phục vụ giám định loài
|
|
Nghiên cứu do các tác giả Bùi Thị Mai Hương, Hoàng Minh Trang, Hà Văn Huân thực hiện.
|
Cây Bách vàng có tên khoa học là Callitropsis vietnamensis là loài cây có giá trị kinh tế cao, gỗ tốt, thơm, có nguồn gốc ở khu vực huyện Quản Bạ, tỉnh Hà Giang thuộc miền Bắc Việt Nam. Hiện nay các loài này đang bị khai thác khá nhiều, hiện chỉ còn khoảng 100 cây còn sống, đứng trước nguy cơ tuyệt chủng.

Ảnh minh họa (Internet)
Do vậy, việc xác định các đoạn DNA barcode cho loài Bách vàng (Callitropsis vietnamensis) phục vụ giám định loài là cần thiết. DNA tổng số được phân lập từ lá cây Bách vàng. Các đoạn DNA barcode (ITS, rbcL, TrnH-psbAvà ITS2) được nhân bản từ DNA tổng số của Callitropsis vietnamensis bằng kỹ thuật PCR. Sản phẩm PCR chỉra rằng các băng thu được có kích thước giống với kích thước dự kiến, sau đó sản phẩm PCR được xác định trình tự. Kết quả phân tích trình tự đã chỉ ra, đoạn ITS có 1158 nucleotide, đoạn rbcL có 599 nucleotide, đoạn TrnH-psbA có 761 nucleotide và đoạn ITS2 có 379 nucleotide. Các trình tự này sau đó được xử lý trên Ngân hàng Gen Quốc tế(NCBI) đã tìm ra sự khác biệt với các loài Bách vàng khác: đoạn gen ITS tương đồng 99% với loài Callitropsis nootkatensis, đoạn gen rbcL tương đồng 100% với loài Callitropsis nootkatensis, đoạn gen ITS2 tương đồng 98% với loài Callitropsis nootkatensis, đoạn gen TrnH-psbAtương đồng 99% với loài Callitropsis nootkatensis. Sau đó đăng ký các đoạn gen rbcL, TrnH-psbA, ITS2 và ITS trên DNABank.vn với mã số: CCV0001; CCV0002; CCV0003; CCV0004. Sử dụng chỉ thị ITS là tốt nhất làm mã vạch DNA để giám định loài Bách vàng Callitropsis vietnamensis ở Việt Nam.
|
nttvy
Theo Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển nông thôn số 14/2020 |