Cây thanh long (Hylocereus undulatus Haw. ) thuộc họ Xương rồng, đây là cây ăn quả nhiệt đới, thích hợp khí hậu nắng nóng, chịu hạn tốt, không chịu được úng; sau khi trồng một năm cây bắt đầu cho quả. Việt Nam là nước nhiệt đới, có khí hậu nóng ẩm, thích hợp với sự phát triển và sinh trưởng của cây thanh long. Tuy nhiên, nhiệt độ cao, lượng mưa lớn cũng là điều kiện thuận lợi cho vi sinh vật phát triển và gây hại. Vi nấm là một trong những tác nhân gây nhiều bệnh trên thanh long như bệnh đốm nâu (do nấm Neoscytalidium dimidiatum), bệnh thán thư (do nấm Coletotrichum gloeosporioides), bệnh thối đầu cành (do nấm Alternaria sp.). Các bệnh này ảnh hưởng đến sinh trưởng phát triển của cây, giảm năng suất, chất lượng quả, giá trị thương phẩm, gây thiệt hại lớn cho người trồng thanh long. Bệnh đốm nâu do nấm Neoscytalidium dimidiatumgây ra là một trong những bệnh hại nghiệm trọng nhất. Bệnh gây hại làm cho cành thanh long bị sần sùi, gây thối khô từng mảng. Trên quả, những đốm làm cho vỏ quả trở nên sần sùi, thối khô làm giảm giá trị thương phẩm nghiêm trọng. Các biện pháp canh tác, biện pháp hóa học đã được đưa vào áp dụng để phòng trừ các bệnh nấm gây ra trên thanh long, tuy nhiên các biện pháp này vẫn còn những hạn chế như chưa tiêu diệt triệt để nguồn bệnh, việc sử dụng các loại thuốc hóa học, thuốc bảo vệ thực vật gây tác động xấu đến môi trường, ảnh hưởng đến sức khỏe con người. Biện pháp sinh học sử dụng các vi sinh vật đối kháng được xem là biện pháp hiệu quả, thân thiện, an toàn với môi trường. Hiện nay, các nghiên cứu về vi sinh vật đối kháng nấm gây bệnh trên thanh long chưa nhiều. Xuất phát từ thực trạng trên, việc nghiên cứu về các chủng vi sinh vật có khả năng ức chế nấm bệnh là vấn đề rất quan trọng được các nhà chuyên môn, tổ chức trong nước và quốc tế quan tâm.

Nghiên cứu do nhóm tác giả Nguyễn Văn Giang, Phùng Thị Lệ Quyên (Khoa Công nghệ sinh học, Học viện Nông nghiệp Việt Nam) và Nguyễn Văn Thành (Viện Di truyền Nông nghiệp) thực hiện tại phòng thí nghiệm Khoa Công nghệ sinh học, Học viện Nông nghiệp Việt Nam từ 10/2017 đến 6/2018.

Từ các mẫu đất vùng rễ cây Thanh long thu từ tỉnh Lạng Giang, Tiền Giang và Long An, 3 chủng vi khuẩn đối kháng mạnh với nấm N. dimidiatum được tuyển chọn. Chủng YMĐ1 có khả năng đối kháng mạnh nhất trong ba chủng, hiệu lực đối kháng dao động từ 60 - 67,5% sau 7 ngày và từ 58,9 - 64,4% sau 12 ngày đồng nuôi cấy. Chủng YMĐ1 có khả năng sinh tổng hợp các enzyme cellulase, amylase, protease, chitinase, tổng hợp siderophoes, IAA và phân giải phosphate khó tan. Kết quả so sánh trình tự nucleotide 16S rRNA của chủng YMĐ1 với dữ liệu trên ngân hàng NCBI cho thấy chủng này có quan hệ gần gũi với loài Bacillus vezenensis.