Ngoài tác dụng làm gia vị thì rau mùi còn được dùng làm thuốc. Thân và lá rau mùi tươi được dùng làm rau thơm tạo mùi dễ chịu, tăng sức hấp dẫn cho món ăn.

Quả của rau mùi (ta quen gọi là hạt) là nguyên liệu chính dùng để làm thuốc và hương liệu. Lá và quả mùi chứa 250 mg% vitamin C (100 g lá hay quả mùi chứa 250 mg vitamin C), 520 mcg% carotene (100 lá hay quả mùi chứa 5200 mcg carotene). Trong lá còn có axit oxalic và Ca. Quả mùi chứa tinh dầu với hơn 1%, lipid 13 - 20%, protein 16 - 18%.

- Quả mùi có vị the cay, mùi thơm, tính ấm, có tác dụng tiêu đờm trệ, đậu sởi dễ mọc, lợi tiêu hóa, an thần, lợi tiểu, sinh tinh, kháng nấm, tiêu độc gan, giảm đường máu, tăng bài tiết sữa, chống ngộ độc rượu…

- Chữa sởi ở con trẻ, bạn lấy một nắm mùi sắc cho trẻ uống lúc còn nóng, đắp chăn cho ra mồ hôi. Dùng ngoài có thể lấy một nắm quả mùi khô giã dập, đem chưng nóng với một ít rượu trắng, gói vào vải thưa, xát toàn thân trẻ, từ đầu tới tay chân, sởi sẽ mọc đều.

Còn một cách khác, tán nhỏ 80 g quả mùi, đun sôi với 100 ml rượu trắng và 100 ml nước sạch. Khi đun nhỏ đậy cho kín, tránh để bay hơi mất hết tinh dầu. Lọc bỏ bã, phun khắp người (trừ mặt) cho trẻ. Sởi sẽ ra, trẻ sẽ hết sốt, hết quấy.

Một cách đơn giản hơn, dùng 160 g quả mùi tươi, cho vào nước đun sôi một dạo, bắc ra để ấm, lấy vải mềm bọc lại và xát vào cơ thể trẻ.

- Chữa đau bụng, đầy bụng không tiêu, buồn nôn sau ăn, bạn lấy một nắm rau mùi với 8 - 10 vỏ quýt, sắc uống. Nếu kèm theo có đau dạ dày, bạn dùng 8 g quả mùi, 4 g đinh hương, 4 g vỏ quýt, 4 g hoàng liên, sắc uống.

- Chữa thiếu sữa cho con bú: Mỗi ngày lấy 6 g quả mùi với 100 ml nước sạch, đun sôi 15 phút, chia làm 2 lần uống trong ngày bạn nhé.

- Chữa bệnh gan thận hư hàn, di tinh, tảo tinh (xuất tinh sớm), rối loạn kinh nguyệt, tiểu không thông, lấy quả mùi đập dập, sao vàng, hãm thay trà uống hàng ngày. Người bệnh tiểu đường typ II, uống trà quả mùi cũng rất tốt, đường huyết giảm nhẹ nhàng. Người bị nhức đầu, ho sốt, cảm hàn cũng nên sử dụng trà quả mùi sẽ thấy đỡ nhức đầu, bớt ho, giảm sốt.

Quả mùi còn dùng để chữa bệnh giun kim: Bột quả mùi (quả mùi khô sao vàng, tán nhỏ) trộn với trứng gà luộc, cho thêm ít dầu mè (vừng), giã nhuyễn, nặn thành dạng thỏi. Nhét thỏi thuốc vào hậu môn trước khi đi ngủ, để suốt đêm. Đặt thuốc liền 3 đêm, trị bệnh giun kim rất hiệu quả.